甲肝病毒主要存在于甲肝患者或隐匿性感染者的粪便中，排毒期长2-3周，在潜伏期末的发病初期大量排毒。因此，甲肝潜伏后期及黄疸出现前数日传染性最强，当黄疸高峰后逐渐消退时，病情好转，传染性亦减弱。一般黄疸出现后两周，虽部分患者粪便中仍可检出病毒颗粒，但实际传染性明显下降，黄疸出现后3周时，患者粪便中已很难找到甲肝病毒，此时基本上无传染性。
近年有人认为，急性甲、乙肝炎患者同住一室，对其出院的乙肝患者进行随访观察，未发现交叉感染甲肝的现象，因此，对黄疸消退后甲肝患者，已无需再行严格限制或隔离。但为了最大限度地防止甲肝扩散，我国规定对甲肝患者采取隔离措施，自发病日起不少于30日。
